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中國藥科大學自2011年開始招收專業學位碩士研究生，截止2023年8月，學校擁有5個專業學位碩士點，1個專業學位博士點。同時，學校為全國藥學專業學位研究生教育指導委員會秘書處掛靠單位。

經過多年的基地建設，截止2023年8月，中國藥科大學擁有152家專業學位研究生實踐基地，其中國家級示范基地5家，重大基地2家，校級基地34家，院級基地120余家，遍布上海、北京、重慶、杭州、蘇州等一線城市。

基地培養學生的學制為3年，其培養模式為“0.5+2.5”，即學生在學校開展半年的理論課學習，隨后赴基地開展兩年半的專業實踐，開展項目研究。

在學生培養方面，實行雙導師制(校內、校外導師共同指導)，推行勝任崗位挑戰的“項目貫通”式培養模式，依托基地發布的新藥研發與評價、藥物質量控制、藥物臨床使用、藥品注冊與監管等方向的行業一線項目，實施項目貫通聯合培養，將項目管理和學生培養環節有機融合。在基地培養的專業學位碩士研究生將在攻讀碩士學位階段接觸并承擔藥學行業一線研究工作。

在制度建設方面，基地針對學校研究生管理相關要求，制定了較為完善的規章管理制度，包括《聯合培養研究生管理暫行辦法》《研究生學位論文開題報告暫行規定》《聯合培養研究生中期考核實施暫行規定》《聯合培養研究生攻讀學位期間發表論文的規定》《研發中心培訓管理規程》《研發中心分級人才培養方案》等，保障學生在基地實踐過程中的培養質量。

在科研條件方面，提供豐富的學習條件與科研資源(包括各種科研數據庫、儀器設備等)，同時提供完成科研任務所需的經費支持，并安排研究生參與科技重大專項等國家級和省級重點科研項目，享受規定的有關權益并享有獲得有關榮譽稱號和獎勵的評選權利。

在生活保障方面，聯合培養研究生除享受國家和學校規定的生活補助等待遇外，基地還為研究生提供一定金額的生活補助并提供免費住宿等。為了提升聯培生德智體全面發展，基地也為學生組織了多種戶外素質拓展活動及文化娛樂活動。

2024年度中國藥科大學招生校級基地如下，院級基地詳情請咨詢學院負責老師(聯系方式附后)：

學校咨詢方式：

研究生院：025-86185537(基地咨詢)025-86185281(招生咨詢)

各學院聯系方式：

藥學院：025-86185301，聯系人：高老師

中藥學院：025-86185132，聯系人：繆老師

生命科學與技術學院：025-86185397，聯系人：許老師

國際醫藥商學院：025-86185036，聯系人：劉老師

理學院：025-86185160，聯系人：劉老師

藥物科學研究院：025-83271052，聯系人：康老師

工學院：025-86185754，聯系人：尚老師

基礎醫學與臨床藥學學院：025-86185655，聯系人：陳老師

生物藥物學院：025-86185986，聯系人：王老師

各基地聯系方式：

現代制藥產業學院校企聯合創新平臺，聯系人：陳老師，025-83271073

南京圣和藥業股份有限公司，聯系人：李老師，15295578973

天津天士力控股有限公司，聯系人：楊老師，022-86342655

中國食品藥品檢定研究院，聯系人：黨老師，010-53851331

美國奧思達藥業(海外基地)，聯系人：付老師，13922759736

正大天晴藥業集團股份有限公司，聯系人：王老師，13851785681

江蘇先聲藥業有限公司，聯系人：周老師，18012600420

公安部禁毒情報技術中心，聯系人：高老師，025-86185301

中國科學院上海藥物研究所，聯系人：楊老師，021-68077909

江蘇省食品藥品監督檢驗研究院，聯系人：胡老師，025-86251020

浙江華海藥業股份有限公司，聯系人：王老師，0576-85016525/15057266206

江蘇康緣藥業股份有限公司，聯系人：崔老師-18761395327/陳老師-13305135520

重慶藥友制藥有限責任公司，聯系人：王老師，13983669910

東部戰區疾病預防控制中心，聯系人：劉老師，13668884537

上海君實生物醫藥科技股份有限公司，聯系人：張老師13761488713，陳老師13795360394

中科中山藥物創新研究院，聯系人：吳老師，0760-85286866轉8844

江蘇豪森藥業集團有限公司，聯系人：喬老師， 0518-83097329 /18652107012

湘北威爾曼制藥股份有限公司，聯系人：孫老師，13851664180

上海市第十人民醫院，聯系人，楊老師，021-66301051

蘇州獨墅湖科教創新區，聯系人，高老師，18914965850