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專業學位與學術型學位處于同一層次，只是培養規格各有側重，在培養目標上有明顯差異。學術型學位按學科設立，其以學術研究為導向，偏重理論和研究，培養大學教師和科研機構的研究人員；而專業學位以專業實踐為導向，重視實踐和應用，培養在專業和專門技術上受到正規的、高水平訓練的高層次人才。專業學位教育的突出特點是學術型與職業性緊密結合，獲得專業學位的人，主要不是從事學術研究，而是從事具有明顯職業背景的工作，如工程師、醫師、教師、律師、會計師等。專業學位與學術型學位在培養目標上各自有明確的定位，因此，在教學方法、教學內容、授予學位的標準和要求等方面均有所不同。

下面用一個列表分析一下專業碩士與學術碩士主要的區別：

除了以上所列區別之外專業碩士與學術碩士還有以下幾點區別：

第一，學制不同。普通碩士：全日制學習。一般為3年。專業碩士：半脫產，學制2-3年。

第二，學費不同。普通碩士錄取為國家計劃內（非定向、定向）的碩士生按國家規定享受免學費待遇。錄取為國家計劃外（委托培養、自籌經費）的碩士生須繳納學費，一般為8000元／年，不同專業有所不同。對于自籌經費生、特困生等考生可通過請國家助學貸款或者商業貸款緩解學費的壓力。專業碩士學費則按照不同專業類別差別較大。例如，MBA的學費要十幾甚至幾十萬元，而工程碩士的學費一般為3-4萬元。專業碩士學位一般不能申請國家助學貸款。

第三，培養模式不同。學術碩士只有一位研究生導師，主要輔導學生的學業而專業碩士實行雙導師制度，一位校內導師輔導學習，一位校外導師輔導學生的社會實踐。