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自我國著名的科學家、教育家盧嘉錫院士1960年創辦我所以來，結構化學是我所的重點研究方向之一，經過近五十年幾代科學家的努力，結構化學研究已在國內外學術同行中具有重要的影響力。結構化學基礎研究室是在此基礎上于2001年成立。研究室以結構化學基礎研究為方向，開展現代結構化學研究方法在探索新功能材料中的應用，探索材料的結構與性能的關系規律，并以此指導新功能材料的研究。

陳忠寧研究員任研究室主任，現有十個課題組，其中研究員十名、博導八名，國家杰出青年基金獲獎者四名，新世紀百千萬人才工程國家級人選四名，"百人計劃"獲得者八名。承擔了973課題、科技部重大課題、國家自然科學基金重點項目、國家杰出青年基金、中科院重大項目、福建省重大項目等研究任務。

重點研究方向：

1）結構化學研究新方法

2）團簇化學

3）金屬-有機框架材料及超分子化學

4）光電磁信息功能材料

5）結構敏感材料

6）固體材料化學