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系統(tǒng)工程系的前身是1979年在錢學(xué)森同志的親自倡導(dǎo)下成立的原國防科技大學(xué)系統(tǒng)工程與數(shù)學(xué)系，1989年轉(zhuǎn)建為國防科學(xué)技術(shù)大學(xué)人文與管理學(xué)院系統(tǒng)工程研究所，2004年轉(zhuǎn)建為國防科學(xué)技術(shù)大學(xué)信息系統(tǒng)與管理學(xué)院系統(tǒng)工程系。系統(tǒng)工程系目前擁有系統(tǒng)工程博士授權(quán)點、軍事裝備學(xué)博士授權(quán)點、工業(yè)工程領(lǐng)域工程碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點和項目管理領(lǐng)域工程碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點。其中，系統(tǒng)工程是國家重點建設(shè)學(xué)科。

系統(tǒng)工程在國防科技發(fā)展中具有重要作用。本單位在學(xué)科建設(shè)中緊緊抓住新軍事變革的發(fā)展機遇，圍繞國防科技發(fā)展的重大需求，培養(yǎng)系統(tǒng)工程高層次人才；運用系統(tǒng)工程的理論、方法和技術(shù)，研究和解決國防科技發(fā)展中的基礎(chǔ)理論、關(guān)鍵技術(shù)和工程實踐問題，凝煉并形成了裝備系統(tǒng)工程、信息系統(tǒng)工程、系統(tǒng)論證與仿真評估和系統(tǒng)工程理論與方法四個特色鮮明、理論與應(yīng)用相結(jié)合的學(xué)科研究方向。

在人才培養(yǎng)方面，本學(xué)科主動適應(yīng)學(xué)科發(fā)展趨勢，積極探索高素質(zhì)新型人才培養(yǎng)的有效途徑，構(gòu)建了多層次、多類型系統(tǒng)工程人才培養(yǎng)體系，培養(yǎng)了大批高水平人才。

在科學(xué)研究方面，實現(xiàn)了科學(xué)研究的跨越式發(fā)展，基礎(chǔ)研究水平不斷提升、科研規(guī)模不斷擴大，科研地位不斷提高。研究方向包括裝備系統(tǒng)工程、信息系統(tǒng)工程、系統(tǒng)論證與仿真評估、系統(tǒng)工程理論與方法。

（1）裝備系統(tǒng)工程

以系統(tǒng)可靠性、試驗統(tǒng)計、信息科學(xué)等理論為基礎(chǔ)，主要研究系統(tǒng)可靠性、安全性、維修決策、試驗鑒定、維修保障信息化、效能評估與分析等方面的理論、方法和技術(shù)，在小子樣可靠性分析與評估、動態(tài)安全性分析、設(shè)備視情維修、綜合保障能力評估、維修性試驗驗證與評價、體系層效能評估與分析等方面形成了自己的特色和優(yōu)勢。

（2）信息系統(tǒng)工程

以系統(tǒng)科學(xué)、信息科學(xué)的理論方法為指導(dǎo)，以應(yīng)用系統(tǒng)為主要研究對象，以信息集成為主要手段，研究信息系統(tǒng)工程的基礎(chǔ)理論、信息系統(tǒng)需求工程、信息系統(tǒng)體系結(jié)構(gòu)技術(shù)、多媒體信息系統(tǒng)與虛擬現(xiàn)實技術(shù)，注重技術(shù)創(chuàng)新與集成創(chuàng)新，在信息系統(tǒng)總體設(shè)計、系統(tǒng)集成與信息可視化方面形成具有自身優(yōu)勢的學(xué)科研究方向。

（3）系統(tǒng)論證與仿真評估

采用系統(tǒng)仿真、系統(tǒng)分析評價與虛擬樣機技術(shù)，研究裝備論證與評估問題。面向裝備的作戰(zhàn)效能評估、裝備體系能力評估、虛擬樣機設(shè)計集成與優(yōu)化、訓(xùn)練模擬和體系頂層設(shè)計等應(yīng)用領(lǐng)域，繼承性與創(chuàng)新性相結(jié)合，開展理論方法、標準規(guī)范、支撐工具、應(yīng)用研究，形成了核心競爭能力。

（4）系統(tǒng)工程理論與方法

研究面向服務(wù)的信息系統(tǒng)綜合集成原理與方法，重點突破以需求工程和體系結(jié)構(gòu)為核心的頂層設(shè)計基礎(chǔ)理論與方法，建立基于信息優(yōu)勢和決策優(yōu)勢的系統(tǒng)綜合集成理論體系，為提高信息系統(tǒng)綜合集成能力提供理論與方法的支持。

通過多年建設(shè)，學(xué)科整體水平和綜合實力得到極大提高，已成為體系設(shè)計和信息系統(tǒng)人才培養(yǎng)與科學(xué)研究的重要基地。