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載運工具運用工程是上海海事大學一級學科交通運輸工程下屬的二級學科之一，于1981年獲碩士學位授予權，2006年獲博士學位授予權，是上海市重點學科。

學科擁有一支高學歷，知識和年齡結構合理，學思想活躍的高素質教學和科研隊伍。現有教授10人（其中博導3人），副教授15人。

學科研究方向：載運工具運用及其環境的仿真技術，載運工具特性研究與運行環境保障，運載工具運用安全與管理和載運工具關鍵技術研究。已為國內外航運院校和研究機構，航運公司、海事管理部門培養了大批的優秀人才。

近三年來，學科的導師共出版專著和在國內外發表論文105篇，其中高質量的檢索論文有5篇。學科點研究生獲4項創新基金項目。學科點研究生招生的質和量近兩年多后較大提高，近4年畢業生平均就業率超過97%。完成的省部級及以上課題4項，科研經費超過3000萬元，在交通運輸領域中享有較高聲譽。

肖英杰領銜的“港航工程通航安全與風險評估”科研團隊為本學科的發展和研究生的培養作出了突出的貢獻。該科研團隊由十幾位碩士生導師、年輕教師和在校的研究生組成，每年承擔了超過30項港航企業委托的課題，將大量安全與風險控制理論應用于科研實踐中，借助我校自行研制的具有世界級先進水平的我校航海模擬器平臺，在為我國港航工程通航安全與風險控制、方案優化，應急預案設計和獲取良好的社會與經濟效益的同時，每年培養的碩士研究生約10名，其中有多名研究生獲校級優秀論文獎。