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生理學科始建于1951年。1981年和1985年分別批準建立碩士學科點和博士學科點，并與其他3個學科共同建立生物學科博士后科研流動站。現本學科　涵蓋生理學教研室、腦功能科學研究中心、教育部腦功能基因組學重點實驗室、上海市腦功能基因組學科重點實驗室和上海市神經科學重點學科等。本學科是國內最早開展神經科學研究的單位之一，具有堅實的研究基礎和豐富的研究積累。研究成果曾獲得全國科學大獎、上海市重大科技成果獎及衛生部優秀成　　果等多項獎勵。進入80年代，研究領域進一步拓寬到聽覺神經生物學、視覺神經生物學、大腦邊緣系統的結構和功能、神經生物化學及分子神經生物學等�！　　�

這些領域已在國內形成明顯的特色優勢，目前在基因、分子、細胞、系統和整體行為等多個水平上開展系統研究，并已取得豐碩成果，總體處于國內領先水平，已成國家自然科學基金資助項目16項，教育部博士點基金6項，國際合作多項。近五年來已在國內外主要學術刊物上發表研究論文195篇，其中在國外SCI期刊上發表45篇，論文多次被國內外同行引用，取得良好知名度，并已與美國、德國、日本、香港、臺灣等建立了密切合作關系。